Nofima bruker molekylærgenetikk til blant annet:
Utvikling av molekylære markører og genetiske kart
For å kunne identifisere de viktigste genene innen en bestemt egenskaper, må vi ha genetiske koblingskart tilgjengelig. Koblingskart inneholder opptil tusenvis av markører fordelt over hele genomet. Nofima har vært sterkt involvert i utviklingen av slike ressurser på atlantisk laks og torsk, og skal jobbe videre med dette på nye arter av internasjonal betydning.
Kartlegging av Quantitative trait locus (QTL) og Markør assistert seleksjon (MAS)
Anvendelse av markørassistert seleksjon (MAS), hvor molekylære markørerer er brukt for å velge bedre stamfisk, basert på koblingen av markørene til gunstige genvarianter (QTL), har et enormt potensial for oppdrettsnæringen i Norge og internasjonalt. For egenskaper som sykdomsresistens, som ikke kan måles på levende avlskandidater, har anvendelsen av MAS potensial til å doble hastigheten for genetisk forbedring sammenlignet med tradisjonell avl. Nofima har hatt stor aktivitet på dette området for å bidra til å løse sykdomsutfordringer i norsk akvakultur. Vi jobber blant annet med utvikling av avlsstrategier som tar i bruk informasjon fra molekylære markører.
Farskapstesting og sporbarhet
Nofima har utviklet og implementert farskapstester basert på molekylære markører hos atlantisk laks og torsk. Bruk av markørbasert familieklassifisering er en spennende mulighet i visse situasjoner for å effektivisere avlsprogram. Markører blir også brukt til å spore oppdrettsfisk i verdikjeden, for eksempel ved tilfeller av sykdom og rømming.
Genuttrykk og genfunksjonsanalyse
Kartlegging av genuttrykk er det samme som å måle samlet effekt (uttrykk) av tusenvis av gener, for å lage et totalt bilde av cellefunksjon. Kartlegging av genuttrykk gir viktig informasjon om hva gener gjør under forskjellige betingelser og kan identifisere uttrykk av visse gener i bestemte typer vev. Forskere ved Nofima bruker kartlegging av genuttrykk for å beskrive fiskens reaksjoner på sykdomsutfordringer og annet stress og undersøker ny bruk av genuttrykksprofiler i avlsprogrammer.
Genetisk ulikhet og genetiske interaksjoner
Det er mange ubesvarte spørsmål i forbindelse med rømt oppdrettslaks og påvirkning på villaks. Vi vet lite om hvordan eller i hvilken grad rømt oppdrettslaks påvirker genprofilen til villaksen i elvene. Nofima bruker molekylære markører til å tallfeste effekten av kryssing mellom oppdrettslaks og villaks, for å bidra med kunnskap slik at riktige forvaltningsstrategier kan bli implementert. Ettersom det stilles økende miljøkrav til oppdrettere i Norge og internasjonalt, vil dette forskningsområdet bli viktig for å oppnå bærekraft innen akvakultur.
Rask utvikling av teknologi innen molekylærgenetikk og molekylærbiologi reduserer kostnadene på slike metoder, samtidig som kapasiteten øker. Disse fagområdene vil slik bli et viktig verktøy i forskning i fremtiden.
