- Jeg jobber i kombinasjonen biologi, kjemi og avansert dataanalyse, oppsummerer stipendiaten når han blir bedt om å gi en kort forklaring på hva doktorgradsarbeidet hans består i. - Mer konkret vil det si at jeg utarbeider dataanalyser basert på at de skal være praktisk anvendelige. Jeg jobber med bilde- og dataanalyse av gelbilder som består av grå og svarte flekker på en hvit bakgrunn, hvor hver flekk representerer et eller flere proteiner og fargeintensiteten representerer mengden protein, utdyper han.
Kjemper mot støy
Et mål er å vise hvordan bilde- og dataanalysen påvirkes av støy i proteinmønsteret. Støy er uønskede variasjoner knyttet til proteinene som ødelegger for den ønskede variasjonen, som for eksempel ulik separering og varierende mengde. I de tilfellene der støyen i bildene ikke kan unngås, må bildene enten preprosesseres eller analysemetodene justeres for å ta høyde for støyen.
Valg av analysemetoder
Et annet mål har vært å se på hvordan valg av analysemetoder påvirker resultatene. Mange forskjellige analysemetoder finnes og de har alle sine fordeler og ulemper.
- I denne oppgaven ble et sett med gelbilder analysert med forskjellige programmer for bildeanalyse og statistisk analyse. Metodene gir stort sett overlappende svar, men jeg har sett at det vil være noe variasjon i resultatene avhengig av hvilke metoder man velger, forklarer Harald Grove.
Studerer hvete
Harald Grove har blant annet studert proteinsammensetningen i hvete, for å finne frem til sorter som gir stabil kvalitet på avlingen. Nærmere bestemt har han studert endringer i proteomet basert på gjødsling. Tilgang til effektive dataanalysemetoder ved gjennomføring av slike forsøk vil kunne gi sikrere resultater raskere, og dermed spare både tid og penger for de som gjør forsøkene. I samarbeid med UMB har det blitt gjennomført forsøk hvor forskjellige hvetetyper har blitt dyrket under ulike betingelser.
- Min del av dette prosjektet har vært å finne frem til optimale dataanalysemetoder for å finne endringer i proteinsammensetningen som følge av forskjellige dyrkingsbetingelser, forklarer Harald Grove.
Harald Grove disputerer for sin doktorgrad i 13. oktober 2008. Han har tidligere en siv.ing.-grad fra NTNU og en mastergrad fra Universitetet for miljø- og biovitenskap (UMB). Hans arbeidssted er Nofima Mat (tidligere Matforsk). Han begynner nå i en post.doc-stilling i Cigene, der han skal arbeide med genomanalyser - trolig i fisk.
